重庆可做的病原感染检测项目（22项）
检测样本中12 种细胞因子的浓度，用于炎症及感染的判断.
3个工作日
血清
用于腺病毒、百日咳杆菌、肺炎链球菌、肺炎支原体、流感嗜血杆菌、博卡病毒、流感病毒A型、人偏肺病毒、卡他莫拉菌、鼻病毒、流感病毒B型、呼吸道合胞病毒、副流感病毒、巨细胞病毒和EB病毒15项病原体感染的辅助诊断
4个工作日
咽拭子/鼻咽拭子；痰液；肺泡灌洗液
用于鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、嗜麦芽假单胞菌、白色念珠菌、耶氏肺孢子虫、结核分枝杆菌、烟曲霉、腺病毒、百日咳杆菌、肺炎链球菌、肺炎支原体、流感嗜血杆菌、博卡病毒、流感病毒A型、人偏肺病毒、卡他莫拉菌、鼻病毒、流感病毒B型、呼吸道合胞病毒、副流感病毒、巨细胞病毒和EB病毒24项病原体感染的辅助诊断
4个工作日
咽拭子/鼻咽拭子；痰液；肺泡灌洗液
用于鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、嗜麦芽假单胞菌、白色念珠菌、耶氏肺孢子虫、结核分枝杆菌和烟曲霉9项病原体感染的辅助诊断
4个工作日
咽拭子/鼻咽拭子；痰液；肺泡灌洗液
检测阴道病原微生物，确定阴道炎等疾病的病原菌
4个工作日
阴道分泌物
用于淋球菌(NG)、沙眼衣原体(CT)、解脲脲原体(UU)、细小脲原体(UP)、人型支原体(MH)、生殖道支原体(MG)、B族链球菌(GBS)、巨细胞病毒(CMV)、人细小病毒B19(B19)、肠道病毒(EnV)、风疹病毒(RBV)11种病原体感染的辅助诊断
4个工作日
新生儿：；取咽拭子；呼吸道或消化道分泌物；肺泡灌洗液；孕妇：；羊水；阴道分泌物(妊娠>35周孕妇)
检测9种致病微生物(阴道加德纳菌、阴道毛滴虫、白色念珠菌、解脲支原体、沙眼衣原体、单纯疱疹病毒 II 型、奈瑟淋病菌、梅毒螺旋体、B 族链球菌)，确定阴道炎等疾病的病原菌。
4个工作日
阴道分泌物
检测细菌、病毒、真菌等病原微生物，确定感染病原及耐药基因，指导抗感染治疗
24-48h
体液或外周血
检测细菌、DNA病毒、真菌和原生生物等DNA病原微生物，同时检测抗性及毒力基因，用于确定感染DNA病原微生物、确定抗性基因、毒力基因表达水平、指导抗生素用药
24-48h
静脉血；痰液；肺泡灌洗液；脑脊液；腹水；胸腔积液；拭子；实体组织；粪便
检测包括细菌、病毒(DNA病毒和RNA病毒)、真菌和原生生物在内共计31033种病原微生物，4417种抗性基因以及484种毒力基因，用于确定感染病原微生物、确定抗性基因、毒力基因表达水平、指导抗生素用药
24-48h
静脉血；痰液；肺泡灌洗液；脑脊液；腹水；胸腔积液；拭子；实体组织；粪便
结核分枝杆菌检测，用于结核杆菌感染的辅助诊断。
6个工作日
全血
结核分枝杆菌检测，用于结核杆菌感染的辅助诊断。
6个工作日
全血
离体分枝杆菌培养，辅助诊断是否存在分支杆菌感染。
20-58个自然日
痰液；尿液；体液(腹水、羊膜腔积液、胆汁、关节腔液、胸膜腔液、滑膜液、胸腔穿刺液等)，无菌离心管；骨髓穿刺液；脑脊液；胃冲洗液或灌洗液；肺泡灌洗液；组织
分枝杆菌10种抗生素敏感性检测：异烟肼、链霉素、乙胺丁醇、利福平、卡那霉素、卷曲霉素、阿米卡星、丙硫异烟胺、对氨基水杨酸、左氧佛沙星，指导临床抗生素药物使用。
在培养阳性结果报告后42日
痰液；尿液；体液(腹水、羊膜腔积液、胆汁、关节腔液、胸膜腔液、滑膜液、胸腔穿刺液等)，无菌离心管；骨髓穿刺液；脑脊液；胃冲洗液或灌洗液；肺泡灌洗液；组织
1. 判定抗酸杆菌的存在与否，辅助诊断结核分枝杆菌感染。
2. 判定肺结核患者在治疗之后是否仍然存在传染性。
3个工作日
痰液；尿液；体液(腹水、羊膜腔积液、胆汁、关节腔液、胸膜腔液、滑膜液、胸腔穿刺液等)，无菌离心管；骨髓穿刺液；脑脊液；胃冲洗液或灌洗液；肺泡灌洗液；组织
结核分枝杆菌及利福平耐药基因检测，用于结核分支杆菌感染的辅助诊断、指导利福平的使用。
3个工作日
痰液；尿液；体液标本(除血液)：胸水、腹水、脑脊液关节腔积液等；肺泡灌洗液
结核分枝杆菌复合群核酸检测，用于结核分支杆菌复合群菌感染的辅助诊断
4个工作日
痰液；体液；尿液；肺泡灌洗液；组织
结核分枝杆菌以下五项耐药基因检测：利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素、氟喹诺酮，用于指导临床用药。
5个工作日
痰液；体液；尿液；肺泡灌洗液；组织
结核分枝杆菌以下任一种耐药基因检测：利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素、氟喹诺酮，用于指导临床用药。
5个工作日
痰液；体液；尿液；肺泡灌洗液；组织
检测范围涵盖76种侵袭性真菌进行靶向测序，明确真菌感染病原种类，辅助临床确定诊疗方案
24-48h
外周血；肺泡灌洗液；痰液；脑脊液；尿液；胸水；腹水；关节液；骨髓；新鲜组织；⑪ 脓肿
检测包含结核分支杆菌7种、非结核分支杆菌66种及麻风分枝杆菌，同时对抗结核的一、二线药物35个耐药基因检测，指导用药
24-48h
外周血；支气管灌洗液；痰液；脑脊液；尿液；胸水；腹水；关节液；粪便；新鲜组织
检测包括细菌、病毒(DNA病毒和RNA病毒)、真菌和原生生物在内共计219种临床常见病原体和828种耐药基因及分型，用于确定血流系统、呼吸系统及神经系统感染病原微生物、确定抗性基因表达水平、指导抗生素用药
24-48h
外周血；痰液；肺泡灌洗液；气道分泌物；咽喉拭子；脑脊液；胸水；腹水